扁桃体结石最常见的症状就是口臭，因为结石中有厌氧菌感染。有些患者会闻到类似于蛋白质腐败的腥臭味。另外，因为扁桃体结石继发于慢性扁桃体炎，因此会出现如咽痛、咽部异物感等症状。