精神心理因素是功能性胃肠病的主因，由此可引发胃肠动力异常、内脏高敏感、肠道菌群紊乱等一系列问题，进一步加重肠胃不适。既往研究表明，功能性消化不良患者的心理障碍共病率高达49.3%，且症状轻重与心理疾病严重程度相关。由于胃肠不适症状常叠加出现、迁延难愈，患者大多存在睡眠问题，伴发焦虑、抑郁等心理问题，可间接增加患病风险。